一.食品供应链环节易出问题
初级生产环节。
农业生产过程缺乏控制，化肥、农药、兽药使用量过大，既造成环境污染，也导致食品的有害物质残留。
食品加工环节。
中国虽然也有很多大型现代化食品企业，但目前大部分食品加工企业都还是10人以下的小规模食品厂或手工作坊，很多企业缺乏必要的安全加工设施和环境。大部分企业虽然有食品卫生标准和制度，但是加工过程缺乏对食品质量和食品卫生进行严格控制的意识。企业经营中普遍存在机会主义行为，产品安全标志与实际状况不相符。更为严重的是，一些食品竟是在缺乏生产许可情况下非法加工出来的，这会给市场秩序和生命安全造成严重威胁。
食品营销环节。
目前我国食品零售渠道主要有超市、农贸市场、副食品商店等。农贸市场虽然存在食品安全监管制度，但缺少足够的食品安全检测手段、检测设备以及检测人员。超市虽然是食品安全信誉较高的地方，但食品安全隐患依然存在，如鲜活产品的有毒有害物质残留超标、随意更改产品保质期、新鲜产品与过期产品 混杂问题等。此外，大量的城市地摊以及农村的集市仍处于安全监管范围之外，一些非法加工的劣质食品逃避监管直接进入市场。
物流环节。
食品物流环节包括运输和储存。我国目前80%的食品通过公路运输，而公路运输中专用运输工具又极为缺乏，此外，食品仓储容量不足、库点分布不合理、规模普遍偏小。由于物流体系不健全，食品在流通环节损耗率高，受到二次污染的可能性大。据估计，2002年食品运输过程中形成的损失不低于750亿美元，海鲜、乳制品等易腐食品售价中的70%是用来补贴流通过程中货损的支出。
二.促进食品供应链可持续性
农业生产环节。
中国政府已经连续多年推动农业产业化经营，在小规模经营短期内难以改善的情况下，通过推动农产品加工企业与农户的联合，稳定农业生产，保障农户从生产中获得更多收益。生产环节的污染和农药残留问题，正通过订单农业以及企业对农户的技术要求和指导加以解决。同时，政府还持续推进农业合作以及耕地的流转和适度集中，推动农业生产效率的提高。
食品物流环节。
中国的物流基础设施和物流产业正在快速壮大。2004年，国家发展和改革委员会出台促进现代物流业发展的政策，鼓励增加对物流业的投资，鼓励企业物流业务的剥离以及独立的物流产业的发展，承诺加强支持物流业发展的基础性工作。
食品加工和销售部门。
随着市场竞争的加剧、信息公开程度的提高以及消费者对市场供求形势的影响，食品加工和销售部门都开始重视食品供应链管理。不仅各产业本身加强了食品安全以及质量管理，而且下游产业纷纷加强了对上游产业的控制，例如加工企业对农业的控制，以及超市对加工企业和农户的控制等。很多食品企业纷纷通过ISO9000、 ISO14000、HACCP等国际认证就是证明。
政府部门。
中国政府正通过强化立法、加强市场监管以及政策扶持来增强我国食品供应链的可持续性。除了卫生部负责食品卫生监督管理外，农业部负责农产品质量安全管理，商务部负责流通领域食品安全管理。国家于2006年出台并施行《农产品质量安全法》，商务部出台的《流通领域食品安全管理办法》于2007年5月1日起施行，农业部也制定专门措施以加强农产品质量安全监管能力建设。根据《全国食品工业“十一五”发展规划建议》，中国将颁布“食品安全法”，建设食品安全信 用体系，加强食品工业与农业的联合，建立健全全国性食品专业物流运输体系，同时鼓励食品加工业的发展。
三.建立可持续食品供应链
延长食品产业链条，发展食品加工业和食品物流业。
在欧洲，现在人们更倾向于短的食品供应链，即从农场直接配送到家庭，以确保食品的安全和新鲜，避免不确定性和信息不对称。但是在中国，总体上农产品加工程度低，食品链不是太长而是太短。发达国家农产品加工业产值与农业产值的比例为3.4∶1，但在中国该比例仅为0.8∶1。因此，在中国大力延长食品产业链条，发展食品加工业和食品物流业大有必要。
增加农民收入，确保食品供应链增加值的公平分配。
西方发达国家增加农民收入有两条途径，分别是政府补贴和农民从市场上获得更好的收入。我国政府的农业补贴近年来虽有所增加，但仍是微不足道。农民市场收入的增加需要靠发展农业合作和农民组织。在中国，农业合作的发展存在先天缺陷，而农业产业化经营被视为增加农民收入的一条重要途径，农民与农产品加工企业实行纵向联合，各自获得产业的平均利润率。但是，由于农民缺乏组织，在与企业合作时缺乏谈判的力量，容易处于不利地位。
加强政府食品安全监管与抑制食品企业的机会主义行为。
目前一些政府部门对于食品安全的认证名不副实，大量“安全食品”未必安全。企业缺乏社会责任，选择投机行为，凭借监管漏洞让存在安全隐患的食品产品进入市场。政府除了加强专业性食品安全监管外，还要致力于构建社会信用体系，加强信息披露，使企业社会责任成为企业的内生激励性行为。“毒奶粉”事件发生后，中国政府随即取消了食品质量免检制度。其实，问题不在免检本身，而在抽检流于形式，而且发现问题后企业缺乏承担后果或者处罚的能力。
充分发挥消费者对食品质量的积极影响力。
随着经济发展水平和居民消费水平的提高，需求方对食品质量的影响力增强，市场秩序会随着消费者的压力而得到改善。在某种意义上，是消费者自己“选择”了何种安全程度的食品。消费者选择总体上是合理的社会现实，但有时也会发出错误的市场信号，例如对乳品中蛋白质含量、三黄鸡的黄颜色、粉丝的白颜色、火锅底料的鲜味的一味追求，都是导致生产者违背常规添加非法物质的重要原因。
